2008年年会8月1～3日在陕西省西安市杨凌区召开。会议由西北农林科技大学承办。参会人员500多名，正式代表466人。会前编印了论文汇编，收入论文150篇。会议主题：棉花科技创新与新农村建设。

　　理事长喻树迅致开幕词。西北农林科技大学吴普特副校长致欢迎词，陕西省农业厅史俊通副厅长、中国农科院原副院长张奉伦出席会议并讲话。大会领衔报告：中国农业大学汪懋华院士《农艺与农工密切结合协力推进棉花生产机械化》、西北农林科技大学吴普特《现代节水农业理论与前沿技术探索》。另外大会报告的有：中国农科院棉花所喻树迅《棉花基因组测序进展》、河北农业大学马峙英《棉花抗病品种资源再生能力、营养利用和基因克隆》、河南农科院经作所房卫平《河南棉花科研进展》、湖北农科院经作所别墅《现代棉花低耗高效栽培技术体系之探索》、中国农业大学华金平《棉花细胞质雄性不育研究进展》、浙江大学祝水金《棉花黄萎病抗性遗传与育种实践》和山东棉花研究中心王留明《鲁棉研28号的选育及主要特点》。会议分设综合、基础与应用基础研究、遗传育种、栽培与植保等4组，共有28人发言，303人次参加了交流和研讨。报告内容涉及抗病资源、杂交育种、航天育种、标记育种，早熟分子育种、棉花野生资源利用、基础研究与生产实践相结合、非生物胁迫等热点问题。

　　会议期间召开常务理事会和理事会，决定增补常务理事1名：邓祥顺，副秘书长1名：王子胜，副理事长1名：李召虎。

　　4个申请承办下年度棉花学会年会的单位做了承办方案的介绍，与会理事质疑与答辩，经过无记名投票，决定了下两年度的年会承办单位：中国农业大学农学与生物技术学院（2009）、辽宁省农科院经左所（2010）。