1988年9月2～6日在新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市召开，与新疆维吾尔自治区作物学会联合举办。会议主题：我国棉花生产的发展战略。会议代表123人，新疆自治区37位代表列席，纺织部、商业部、中纺棉花进出口公司、山东省纺织厅等派员出席会议。
第二届理事长臧成耀致开幕词，并做了第二届理事会工作报告。中国农学会会长卢良恕、新疆自治区党委副书记粟寿山到会讲话。会议投票选举产生第三届理事会和领导成员，理事65人，常务理事29人。会议提交论文201篇，大会发言两天半，32人做了大会报告。
会议评选出优秀论文29篇。会议还对为学会工作付出大量心血的学会干部70人颁发奖状、会徽，以表彰他们对学会工作的贡献。
会议特别向国务院提出了有关调动农民增产棉花的积极性、成立国务院棉业委员会等两项建议。
会议形成《关于稳定发展我国棉花生产的几点建议》：⑴ 提高棉花收购价格，建立棉花风险基金。⑵ 生产资料要切实保证合理价格和及时供应，增加水利建设的投资与农业机械和电力的供应，鼓励和支持棉农增加投入，努力改善生产条件。⑶ 重点建设好10万亩以上的约300个集中产棉县，健全农业科技服务体系，促进商品棉生产的发展。⑷ 改革棉花种子经营体制。⑸ 开展棉副产品综合利用，提高植棉经济效益。⑹ 改革我国现行棉花管理体制。
会议期间，代表们赴石河子参观了新疆生产建设兵团农八师148团农场。
会后编印论文集，收录会议文件和论文141篇。
