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Genome-wide association study identified genetic variations and candidate genes for plant architecture component traits in Chinese upland cotton

  • 期刊名称Theoretical and Applied Genetics
  • 发表年份2018
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  • 添加时间2021年09月18日

论文简介:本研究基于一个包含355份陆地棉种质资源的自然群体,通过简化基因组测序,得到93,250个SNPs。通过GWAS鉴定得到22个SNP与5个棉花株型相关的显著相关。通过分析发现,位于D03染色体上的四个SNP位点均位于同一个连锁不平衡区。基于此,对该0.95 Mb候选区域的基因进行分析。其中有一个基因(Gh_D03G0922)在一个显著相关的SNP 位点D03_31584163附近。qRT-PCR结果显示,Gh_D03G0922在矮小紧凑的棉花品种的顶芽和幼叶中高量表达。VIGS结果表明,Gh_D03G0922沉默以后,棉花株高明显降低。本研究候选基因的鉴定为棉花株型育种奠定了基础。

原文链接:https://doi.org/10.1007/s00122-018-3079-5