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Identification of candidate genes for key fibre-related QTLs and derivation of favourable alleles in Gossypium hirsutum recombinant inbred lines with G. barbadense introgressions

  • 期刊名称Plant Biotechnology Journal
  • 发表年份2020
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  • 添加时间2021年09月18日

论文简介:该研究以渗入了海岛棉基因组组分的优质种质鲁原343为亲本,构建了包含239 个重组自交系的遗传作图群体,利用SLAF标签构建了高密度遗传图谱,结合7个环境的表型数据,共鉴定104个纤维品质和产量性状QTLs,其中66个QTL共定位于19个QTL簇中。该研究团队通过进一步对鲁原343进行全基因组深度测序,解析鲁原343的遗传组成及其对纤维相关性状的遗传贡献,发现来自G. hirsutum races(陆地棉野生种系)的基因组组分对纤维品质的遗传贡献大于来自G. barbadense的基因组组分。通过联合分析DNA-resequencing、RNA-seq和RT-qPCR结果,鉴定了6个候选基因,包括Gh_A03G1147 (GhPEL6),Gh_D07G1598 (GhCSLC6) 和Gh_D13G1921 (GhTBL5) 与纤维长度发育相关,Gh_D03G0919 (GhCOBL4), Gh_D09G1659 (GhMYB4) 和 Gh_D09G1690 (GhMYB85) 与衣分性状的形成相关。

原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/pbi.13237