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Patterns of presence-absence variants in Upland cotton

  • 期刊名称SCIENCE CHINA Life Sciences
  • 发表年份2020
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  • 添加时间2021年09月18日

论文简介:在这项研究中,我们对七个优良棉花品种的PAV模式进行了综合分析,发现大部分PAV小于20kb,小于40kb的PAV总共有1.27Gb,占到整个基因组的50.7%,大于40kb的PAV共有15430个,共有1.23Gb,占到整个基因组的49.3%。基因结构分析发现大部分缺失型PAV不在内含子区域或者外显子区域,说明这些PAV可能不对基因功能起直接作用。多倍性PAV主要定位在内含子区域,并且紧邻外显子,这部分PAV可能对基因功能起直接作用。本研究对阐明此类模型的生物功能具有重要意义。

原文链接:https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/s11427-019-1602-y.pdf